На вероятный
уровень повышения гомозиготности, то есть на
вероятный процент генов, перешедших в гомозиготное
состояние, по сравнению с процентом гомозиготных
генов, имеющих место во всей популяции животных,
указывает коэффициент Райта.
Коэффициент Райта изменяется от нуля, что
соответствует полной гетерозиготности, до полной,
теоретически возможной гомозиготности, равной
единице или 100 %.
Если предок, на которого заинбридировано изучаемое
животное (пробанд), сам не инбреден, то формула
коэффициента Райта выглядит довольно просто:
,
где Fx
коэффициент инбридинга у пробанда;
∑ -
знак, обозначающий сумму всех встречающихся
инбридингов в родословной;
n число путей инбридинга
от общего предка, через животное
X по отцовской стороне родословной к общему
предку с материнской стороны, исключая пути от
самого общего предка.
Вспомним родословную Таира-Талисмана.
Он сын Еддги Амаля и в то же время его внук по
матери.
Рисунок SEQ Рисунок \* ARABIC 8
Для наглядности удобно построить стрелочную
диаграмму, в которой покажем только связи (пути),
соединяющие пробанда с особью, на которую он
заинбридирован. Для краткости клички заменим буквами:
Х Таир, А Еддги Амаль, Б Гекса Бессер.
Рисунок SEQ Рисунок \* ARABIC 9
Путь инбридинга от А через Х и Б к А составляют три
стрелки. Но две из них, идущие от А, нужно исключить
по условию.
Остается один путь от Б к Х.
Поэтому формулу Райта можно записать так:
Это означает, что с большой вероятностью у
Таира-Талисмана 25 % генов перешло в гомозиготное
состояние.
Исследуем скрещивание родных брата с сестрой (полных
сибсов).
Рисунок SEQ Рисунок \* ARABIC 10 - а) вот их
родословная; б) а так выглядит стрелочная диаграмма
Здесь пробанд Х заинбридирован на В и на Г.
Для В путь будет А Х Б, включающий две стрелки
=0.52=0.25
И для Г путь будет А Х Б, также включающий две
стрелки =0.52=0.25
_________
∑ =0.50
Как и при спаривании родитель дочь, так и в случае
спаривания сибсов, коэффициент Райта одинаков 25
%, но в первом случае накапливаются гены одного
предка, а во втором двух предков (деда и бабки).
Животноводы-практики считают спаривание брата с
сестрой более рискованным, чем спаривание отца с
дочерью, хотя возрастание гомозиготности в обоих
случаях одинаково.
Каков же будет коэффициент инбридинга Райта у
потомка, полученного от скрещивания сводных брата и
сестры (полусибсов)?
Рисунок SEQ Рисунок \* ARABIC 11 - а) родословная;
б) стрелочная диаграмма
Круговой путь инбридинга на В будет А Х Б,
включающий в себя две стрелки (стрелки от В не
учитываются).
Тогда
В данном сочетании у пробанда Х вероятно перешло в
гомозиготное состояние 12.5 % генов.
Но вот еще одна родословная. И ее стрелочная
диаграмма.
Рисунок SEQ Рисунок \* ARABIC 12 - В этой
родословной пробанд Х является результатом двух
последовательных скрещиваний с кобелем А; у предков
Х два акта инбридинга: первый - вязка А с его
дочерью Б (путь Х - Б), второй - вязка А с его
дочерью Д (путь Х - Б - Д)
Таким образом, путь Х Б =0.51=0.5
путь Х Б Д
=0.52=0.25
_________
∑ =0.75
При подсчете F нужно
искать в родословной все возможные инбридинги.
Вносят ли особи В и Г (родители А) свой вклад в
инбридинг Х? хотя они присутствуют как со стороны
отца, так и со стороны матери, но их вклад в уровень
гомозиготности Х полностью перекрывается вкладом
особи А.
Приведем еще одну родословную и ее стрелочную
диаграмму.
Рисунок SEQ Рисунок \* ARABIC 13 - Пробанд Х -
продукт двойного инбридинга (на В и на Г)
Путь инбридинга на В будет А Х Б Д =0.53=0.125
Путь инбридинга на Г будет А Х Б Д =0.53=0.125
___________
∑ =0.250
Подсчитываются все инбридинги на разных предков, так
как коэффициент инбридинга дает представление о
суммарном повышении гомозиготности у пробанда Х, а
не долю отдельного предка в его родословной.
Таблица SEQ Таблица \* ARABIC 12 - Вспомогательная
таблица значений 0.5, возведенной в степень
Степень, в которую нужно возвести 0.5 |
Значение 0.5, возведенной в степень, в
десятичных дробях |
Значение 0.5, возведенной в степень, в
процентах |
1 |
0.5000 |
50.00 |
2 |
0.2500 |
25.00 |
3 |
0.1250 |
12.50 |
4 |
0.0625 |
6.25 |
5 |
0.0313 |
3.12 |
6 |
0.0156 |
1.56 |
7 |
0.0078 |
0.78 |
8 |
0.0039 |
0.39 |
9 |
0.0019 |
0.20 |
10 |
0.0010 |
0.10 |
В случае если особь, на которую производится
инбридинг, сама инбредна, то формула коэффициента
Райта приобретает следующий вид:
,
где FX
коэффициент инбридинга пробанда;
∑ - сумма всех путей инбридинга;
n число путей от общего
предка через животное Х к общему предку с
материнской стороны, исключая самого общего предка и
пути от него;
fa
коэффициент инбридинга предка, на которого
заинбридирован Х.
Например, пробанд Х получен от спаривания отца с
дочерью при заинбридированном отце.
Рисунок SEQ Рисунок \* ARABIC 14 - а) родословная;
б)стрелочная диаграмма
Вычислим fa
коэффициент инбридинга отца (А).
Путь Б А В =0.52=0.25
Путь Б А В =0.52=0.25
________
∑ =0.50
Коэффициент отца
Тогда путь инбридинга Х равен пути Х Ж =0.51
или
У
изучаемого пробанда Х в результате инбридинга на
инбредного отца перешло в гомозиготное состояние не
25 % генов, как было бы, если бы отец А не был бы
заинбридирован, а 31 %.
А
теперь рассмотрим родословную, в которой
осуществлялись бессистемные инбридинги, как это
часто случается в собаководстве.
Рэм
Х |
Джо
В |
Вест
В |
Моро
Е |
Наль
К |
Ялта
Л |
Асси
Ж |
Джой
М |
Ялта
Л |
Кате
Г |
Ким
З |
Джой
М |
Хэппи
Н |
Асси
Ж |
Джой
М |
Ялта
Л |
Шерри
Б |
Вест
В |
Моро
Е |
Наль
К |
Ялта
Л |
Асси
Ж |
Джой
М |
Ялта
Л |
Дива
Д |
Моро
Е |
Наль
К |
Ялта
Л |
Жига
И |
Наль
К |
Хэппи
Н |
Рисунок SEQ Рисунок \* ARABIC 15 - Родословная
гипотетическая, все клички взяты произвольно
Для того, чтобы стрелочная диаграмма была менее
громоздкой, заменим клички буквами.
Пробанда Рэма обозначим Х, а остальных буквами
русского алфавита, как в предыдущих схемах.
Тогда стрелочная диаграмма будет выглядеть так.
Рисунок SEQ Рисунок \* ARABIC 16
Сначала составим список общих со стороны отца и со
стороны матери предков. В родословной их 7.
Вест В, Асси Ж, Моро Е, Джой М, Ялта Л, Наль К и
Хэппи Н.
Затем нужно определить число разных путей,
соединяющих одного и того же предка с пробандом со
стороны отца и со стороны матери.
В IV колене родословной
чаще всего встречается Ялта Л.
Общее число выходов на нее может быть:
ЕВАХБВЕ ЖВАХБВЕ ЖГАХБВЕ
ЕВАХБВЖ ЖВАХБВЖ ЖГАХБВЖ
ЕВАХБДЕ ЖВАХБДЕ
ЖГАХБДЕ
Выходов на Л (Ялту) всего девять. Но только три из
них удовлетворяют правилу, что на пути инбридинга
каждая кличка должна встречаться только один раз.
Это ЖВАХБДЕ, ЖГАХБВЕ и ЖГАХБДЕ.
Часть общих предков может иметь лишь один путь
инбридинга, как например Вест, а другие и несколько,
как Ялта (Л).
Поэтому следует составить таблицу ходов инбридинга.
Таблица SEQ Таблица \* ARABIC 13
Предок |
Ход инбридинга |
0.5n |
Коэффициент инбридинга
|
Вест (В) |
АХБ |
0.52=0.250 |
0.125(1+fB)=0.141 |
|
|
|
|
Асси (Ж) |
ГАХБВ |
0.54= |
|
|
|
=0.53=0.125 |
0.062 |
Моро (Е) |
ВАХБД |
0.54= |
|
|
|
|
|
Джой (М) |
ЗГАХБДИ |
0.56= |
|
|
|
=0.55 |
|
Ялта (Л) |
ЖВАХБДЕ |
0.56= |
|
|
|
=0.54=0.062 |
0.031 |
Ялта (Л) |
ЖГАХБВЕ |
0.56= |
|
|
|
=0.55 |
|
Ялта (Л) |
ЖГАХБДЕ |
0.56= |
|
|
|
|
|
Наль (К) |
ЕВАХБДИ |
0.56= |
|
|
|
=0.55=0.031 |
0.016 |
Хэппи (Н) |
ЗГАХБДИ |
0.56= |
|
|
|
|
Сумма 0.250 |
Примечание Вест сам заинбридирован на Ялту (Л), и
это усиливает гомозиготность Рэма.
Рисунок SEQ Рисунок \* ARABIC 17 - Инбридинг Веста
(В) учитывается отдельно
И поправка (1+fB)
должна быть включена в коэффициент инбридинга Веста.
Имеется следующая математическая закономерность:
Например:
Таким образом, общий суммарный коэффициент
инбридинга пробанда Х (Рэма) равен сумме всех
коэффициентов 0.25 или 25 %. Иначе, эта цифра
показывает высокую вероятность того, что 25 % всех
генов Рэма перешло в гомозиготное состояние.
Если FX (степень
гомозиготности) меняется от 0 до 1 (или от 0 до 100
%), то степень гетерозиготности представляет собой
1‑FX.
Гетерозиготность равна 100 %, когда сочетание
полностью аутбредно, и равна 0, когда
FX=1 или 100 %.
Ни того, ни другого практически не бывает. Но нужно
стремиться, чтобы в ряду поколений гетерозиготность
уменьшалась, а гомозиготность увеличивалась медленно.
Для более быстрых расчетов можно пользоваться
следующей таблицей. Важно только учитывать все
встреченные в родословной инбридинги.
Таблица SEQ Таблица \* ARABIC 14 - Значение
коэффициентов инбридинга в процентах
Ряд родословной отца |
Ряд родословной матери |
I |
II |
III |
IV |
V |
VI |
VII |
VIII |
I |
- |
25.000 |
12.500 |
6.250 |
3.120 |
1.560 |
0.780 |
0.390 |
II |
25.000 |
12.500 |
6.250 |
3.120 |
1.560 |
0.780 |
0.390 |
0.200 |
III |
12.500 |
6.250 |
3.120 |
1.560 |
0.780 |
0.390 |
0.200 |
0.100 |
IV |
6.250 |
3.120 |
1.560 |
0.780 |
0.390 |
0.200 |
0.100 |
0.050 |
V |
3.120 |
1.560 |
0.780 |
0.390 |
0.200 |
0.100 |
0.050 |
0.025 |
VI |
1.560 |
0.780 |
0.390 |
0.200 |
0.100 |
0.050 |
0.025 |
0.013 |
VII |
0.780 |
0.390 |
0.200 |
0.100 |
0.050 |
0.025 |
0.013 |
0.006 |
VIII |
0.390 |
0.200 |
0.100 |
0.050 |
0.025 |
0.013 |
0.006 |
0.003 |
Таблица SEQ Таблица \* ARABIC 15 - Классификация
тесноты инбридинга
Название инбридинга |
Типы инбридинга по Шапоружу |
Коэффициент Райта |
Инбредная линия |
Спаривание братьев с
родными сестрами или родителей с детьми в
ряде поколений |
0.4 и выше (40 % и выше) |
Очень тесный (кровосмешение)
in-and-in
breeding |
Спаривание братьев с
сестрами (II‑II
на отца + II‑II
на мать).
Спаривание родителей с
детьми I‑II,
II‑I |
0.25 (25 %)
0.25 (25 %) |
Тесный или близкий
close breeding |
Спаривание деда с
внучкой III‑I,
бабки с внуком I‑III,
полубрата с полусестрой
II‑II
Спаривания
III‑II,
II‑III,
I‑IV,
IV‑I |
0.125 (12.5 %)
0.125 (12.5 %)
0.062 (6.25 %) |
Умеренный
line breeding |
Спаривания
III‑III,
I‑V,
V‑I
Спаривания
II‑V,
V‑II,
III‑IV,
IV‑III,
I‑VI,
VI‑I
Спаривания
IV‑IV,
III‑V,
V‑III,
II‑VI,
VI‑II |
0.031 (3.12 %)
0.156 (1.56 %)
0.008 (0.78 %) |
Отдаленный |
Спаривания
IV‑V,
V‑IV
Спаривания
V‑V
Спаривания
V‑VI,
VI‑V
И далее |
0.004 (0.39 %)
0.002 (0.20 %)
0.001 (0.10 %) |
При отдаленных инбридингах, конечно, могут
проявиться в фенотипе потомка скрытые рецессивные
гены, но особого значения для целенаправленного
применения отдаленные инбридинги не имеют.